普洱茶的自然存储陈化，其实质是普洱茶在存储过程之中持续的后发酵。茶叶的内含成分主要是由茶多酚、氨基酸、生物碱、维生素、叶绿素等物质以及一些香气成分组成。
这些组成成分多为还原性物质，极易受湿度、温度、光线和氧气等环境因素的影响，自身或相互进行水解反应、氧化反应、缩合或聚合反应等，从而产生一系类变化。
造成其物质构成、含量的显著改变，使普洱茶的滋味、功效也随之发生改变。
普洱茶“陈化”过程中，茶叶内含化学成分进行非酶促自动氧化，发生氧化、降解和转化，引起褐色物质形成和香味改变。在茶叶仓储过程中，类酯化合物氧化，产生具有陈茶气味特征。