紫娟与紫芽，常常被人们相提并论，甚至一些茶叶店主，都分不清两者区别。根据本人了解，两者主要有以下区别：
1、从来源看，紫芽是天然发生的变异，具有随机性。而紫娟是人工培育的一种新品种，整片紫娟茶园都是统一的颜色统一的品性。紫芽会有年代久远的古树紫芽茶，而紫娟则全都是新种植的小茶树。
紫娟茶鲜叶的颜色几乎为全部紫红
2、从品种看，紫芽并不是独立的一个茶种，而“紫娟”茶树是科研选育的成果，上世纪80年代从云南大叶群体种中发现，后经单株培育而成，具有紫茎、紫叶、紫芽的独特品貌。2005年，紫娟通过了国家林业局新品种保护权。《红楼梦》中林黛玉的贴身丫环名“紫鹃”，这种茶树也具有“紫尖”（紫色的芽尖）的特征，所以以谐音为这种独特的茶树品种取了一个与众不同的名字——“紫娟”。
3、从分布来看，紫芽在任何大叶种茶园中都可能偶然发生，数量不可控。而紫娟是人工种植，至今已在西双版纳、普洱、临沧、保山等茶区推广种植了3000亩左右。
4、从加工过程看，紫芽鲜叶和普通大叶种叶片厚度区别不大，紫娟则明显叶片小而薄，在制作过程中有明显的“粘手、粘锅”。
5、从保健功效看，两者都有科研证据支撑，具有一定保健功效。
6、从茶汤看，紫芽茶汤为金黄色，而紫娟茶汤为略带紫色。紫娟茶因富含天然花青素，用ph值不同的水冲泡，汤色和滋味会发生相应的变化，采用ph值7.0左右的中性饮用纯净水冲泡紫娟茶，水温也要控制在90℃左右，能冲泡出花果香显著、柔紫明亮、浓醇回甘的紫娟茶。若水的ph＜5.0，茶汤颜色会逐渐转为红色；若水的ph＞8.0，茶汤颜色会逐渐向暗绿色转变。
特定光线条件下紫娟茶汤的紫红色显得特别突出
7、从市场价值看，随着种植面积增加，紫娟产量增加，一斤上万的天价时代已经过去。但物依稀为贵，紫芽和紫鹃都处于普洱茶市场平均价以上的价位。