历史文化区别
武夷水仙为历史名茶，是闽北乌龙茶中的两个品种之一。水仙是武夷山茶树品种的一个名称，武夷水仙就是以品种命名的。武夷山茶区素有“醇不过水仙，香不过肉桂”的说法。
普洱茶名重天下，源于东汉，兴于唐宋，盛于明清。主要产于云南西双版纳等地，因自古以来即在普洱集散，因而得名。普洱茶是采用绿茶或黑茶经蒸压而成的各种云南紧压茶的总称，包括沱茶、饼茶、方茶、紧茶等。普洱茶的历史可以追溯到东汉时期,距今已达两千年之久。民间有“武侯遗种”之说，武侯是指三国时期的丞相诸葛亮，故普洱茶的种植利用，至少已有1700多年的历史。千百年来，普洱茶深受广大消费者青睐，皆因茶质优良。
制作工艺区别
水仙鲜叶原料以中开面一芽三叶为佳，据试验对比：小开面开采的成茶香低味涩，大开面开采的吃水淡薄。采摘应严加管理，应轻收轻放，速运，薄摊，通风，防止损伤劣变。依不同采摘时间，树龄，早晚青，雨水青，分别摊放管理。鲜叶采摘后经过晒青、做青、炒青、初揉、复炒、复揉、走水焙、簸拣、摊凉、挑剔、毛茶、补火等工序制成。
普洱茶有其独特的加工工序，一般都要经过杀青、揉捻、干燥、渥堆等几道工序。鲜采的茶叶，经杀青、揉捻、干燥之后，成为普洱毛青。这时的毛青，韵味浓峻、锐烈而欠章理。毛茶制作后，因其后续工序的不同分为“熟茶”和“生茶”经过堆闷转熟的就成为“熟茶”再经过一段相当长时间贮放，待其味质稳净，便可货卖。贮放时间一般需要3——5年。
“生茶”指毛茶不经过堆闷工序而完全自然转化。自然转化的进程相当缓慢，至少需要5——8年。完全稳熟后的生茶，其陈香中仍然存留活泼生动的韵致，且时间越长，其内香及活力亦发显露和稳健，由此形成普洱茶“做新茶卖旧茶”的形式。
冲泡口感区别
武夷水仙茶外形肥壮，色泽绿褐油润而带宝色，部分叶背呈现沙粒，叶基主脉宽扁明显，香浓锐，有特有的“兰花香”，味浓醇厚，喉韵明显，回甘清爽，汤色浓艳带深橙黄色，耐冲泡，叶底软亮，叶缘红点鲜红。
普洱茶口感丰富多变，地域山头不同、年份不同、拼配和古树，口感也不一样。各个山头地域、年份均有其独特的滋味，例如老班章以刚猛霸道著称，而易武则以阴柔细腻闻名。由于普洱茶有越陈越香的特性，存放时间长的茶就要比新茶醇厚浓郁，刺激性减弱，价格也要贵的多。好的普洱茶可以一般能冲二十余泡，而茶味却是愈见香浓。
功效与作用区别
武夷水仙茶中的茶多酚和鞣酸作用于细菌，能凝固细菌的蛋白质，将细菌杀死。可用于治疗肠道疾病，如霍乱、伤寒、痢疾、肠炎等。皮肤生疮、溃烂流脓，外伤破了皮，用浓茶冲洗患处，有消炎杀菌作用。口腔发炎、溃烂、咽喉肿痛，用茶叶来治疗，也有一定疗效。
普洱茶功效的现代研究共列述20项，即减肥、降脂、防治动脉硬化、防治冠心病、降压、抗衰老、抗癌、降糖、抑菌消炎、减轻烟毒、减轻重金属毒、抗辐射、兴奋中枢神经、利尿、防龋齿、明目、助消化、抗毒、灭菌、预防便秘、解酒及其他，部分功效是与中医有关，如兴奋中枢神经与少睡有关、利尿与排毒有关等。还能能帮助消化，有效刺激人体新陈代谢加速分解小腹的赘肉。